Dans cet article on s'intéresse au problème du filtrage des signaux par une méthode pilotée par les données, à savoir la décomposition modale empirique (EMD). Le signal filtré est obtenu par une reconstruction partielle des modes empiriques (IMFs) extraits par l'EMD et ce en utilisant un critère énergétique mesurant l'écart quadratique moyen entre deux reconstructions consécutives, le CMSE (Consecutive MSE). L'approche CMSE, largement utilisée dans la littérature du domaine, fournit un moyen simple pour estimer des signaux, en présence de bruit. Cela étant, ce filtrage est global. Ainsi, pour les signaux d'intérêt caractérisés, par exemple, par des détails fins, des événements courts ou peu contrastés (non stationnaires) cette approche a tendance à mal les reconstruire au détriment des grandes structures du signal informatif. On propose dans cet article, une approche locale ou par blocs de la méthode CMSE qui permet d'améliorer les performances de la reconstruction du signal d'intérêt. Des résultats de simulation sont présentés et comparés à ceux de l'approche par ondelettes.