L’invention concerne un procédé de configuration d’un circuit logique programmable à partir d’un flux binaire de configuration, le circuit logique programmable comprenant une entrée de configuration de circuit pour le chargement du flux binaire de configuration et une pluralité de modules logiques programmables comprenant chacun une entrée de module et une sortie de module, le procédé comprenant : - définir un vecteur de méta-configuration comprenant une succession de champs de sélection d’une source de configuration de module parmi une pluralité de sources de configuration de module, - segmenter le flux binaire de configuration en une pluralité de segments binaires de configuration, - charger ledit vecteur de configuration dans un registre de méta-configuration du circuit logique programmable, puis, - charger respectivement lesdits segments binaires de configuration dans lesdits modules logiques programmables selon les valeurs desdits champs dudit vecteur de méta-configuration.